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【学术报道】生物图像数据驱动的物理学研究-肿瘤内细胞成序的机制

2019年10月09日 00:00  点击:[]


  2019
927日,应博彩论坛 邀请,中科院深圳先进技术研究院合成生物研究所李雪飞副研究员于仙林校区物科院行健楼437会议室作了题为“生物图像数据驱动的物理学研究-肿瘤内细胞成序的机制”的学术报告。报告由物科院童培庆教授主持,相关领域的教师和学生参加了本次学术报告会。
  李副研究员把肿瘤抽象成一个多类细胞组成的复杂系统,利用物理学的研究模式,试图揭示该复杂体系的关键相互作用。在肿瘤内,多类细胞有序排布,更重要的是,这种细胞序对癌症的发展可以起到关键的作用。
  首先,通过物理模型研究,揭示细胞液晶序的形成机制。在实体肿瘤内,成纤维细胞环绕包裹着肿瘤细胞团簇。同时,在体外细胞培养实验中,在相对宽阔的准二维通道内,这些成纤维细胞最终可自组织形成完美的液晶序。通过物理模拟椭圆形自驱动“细胞”在二维平面上的动力学过程,我们证明,细胞与其自分泌的外基质纤维网络的相互作用,是细胞长程液晶序形成的关键。
  其次,通过将图像数据的定量分析与物理模型研究相结合,揭示免疫细胞空间分布的物理生物机制。对于多种癌症类型,特定的免疫细胞在肿瘤内的侵入程度越高,患者的生存期越长。通过定量分析了肿瘤切片图像数据,定量刻画了细胞毒性 T 淋巴细胞的空间分布特征。进一步的,以这些定量的统计特征为出发点,通过构建并分析一系列基于反应-扩散方程的物理模型,阐明了限制相关 T 细胞入侵肿瘤的排斥物机制。
  报告结束后,李副研究员对老师和同学们提出的问题进行了详细解答,指出他们的工作揭示了肿瘤内多类细胞有序分布背后的物理机制,并为开发新的肿瘤治疗策略提供了理论支撑。

李副研究员简历:
李雪飞,中科院深圳先进技术研究院合成生物研究所副研究员,本科毕业于浙江大学物理系,于2008年至2012年在香港浸会大学攻读博士,主要从事细菌代谢网络以及利用细菌治疗肿瘤的理论研究。博士后阶段,进入美国莱斯大学的理论生物物理研究中心,从事肿瘤微环境的理论研究。在莱斯大学期间(2015-2019),发表第一作者文章4篇,其中包括2PNAS。李博士的专业特长主要是对生物系统的数理建模分析,以及对生物数据的定量分析。


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